擬訂中醫(yī)藥防治重大疾病規(guī)劃并組織實施。擬訂中醫(yī)醫(yī)療機構及醫(yī)務人員、醫(yī)療技術應用、醫(yī)療質量、醫(yī)療安全、醫(yī)療服務以及行風建設等行業(yè)管理政策規(guī)范、標準并監(jiān)督實施。擬訂公立中醫(yī)醫(yī)院運行監(jiān)管、績效評價和考核制度。承擔推進中醫(yī)護理、康復發(fā)展有關工作。擬訂基層中醫(yī)藥服務政策、標準和規(guī)范并組織實施，指導基層中醫(yī)藥服務體系建設。指導全國中醫(yī)應急體系和能力建設，組織開展傳染病和突發(fā)事件中醫(yī)藥應急工作。