2003年局機關和直屬單位黨建工作的總體思路是：以鄧小平理論和“三個代表”重要思想為指導，認真貫徹黨的十六大精神，堅持圍繞中心、服務大局，與時俱進，開拓創新，全面推進機關和直屬單位黨的思想、組織、作風和制度建設，開展黨員先進性教育，努力建設一流隊伍、培育一流作風、創造一流業績，保證各項任務的順利完成，為開創中醫藥事業新局面做出新的成績。
    一、把學習貫徹“三個代表”重要思想放在首位，抓好理論武裝工作
    1、要按照《中共中央關于認真學習貫徹黨的十六大精神的通知》要求，把學習貫徹十六大精神作為全年黨建工作的首要政治任務，認真抓緊抓好。在學習中要圍繞主題，把握靈魂，明確目標，抓住關鍵，切實把廣大干部職工的思想認識統一到十六大精神上來。
    2、要用“三個代表”重要思想統領局機關和直屬單位黨的建設，牢牢把握關鍵在堅持與時俱進，核心在堅持黨的先進性，本質在堅持執政為民的根本要求，理論聯系實際，把“三個代表”重要思想貫徹到黨建工作和各項業務工作中去。要深入研究本部門本單位改革發展的重大戰略問題，在開拓創新上下功夫，理清思路，創造性地開展工作。
    3、繼續嚴格執行領導干部定期脫產培訓學習制度，認真落實處級以上領導干部脫產輪訓計劃。還要認真落實《國家中醫藥管理局機關各部門黨支部書記理論學習責任制》和《國家中醫藥管理局機關在職領導干部自學制度》，并逐步探索處級以上領導干部理論學習考核評價機制。
    二、切實加強基層黨組織建設，不斷提高黨組織的創造力、凝聚力和戰斗力
    4、抓好《中國共產黨黨和國家機關基層組織工作條例》的貫徹落實，特別要抓好黨內各項規章制度的執行。要根據十六大的要求，積極改革和完善黨的領導方式和執政方式、領導體制和工作制度，探索健全黨組織生活和活動的新機制、新方法，不斷增強基層黨組織的生機、活力和自主開展活動的能力。
    5、局機關和直屬單位各級黨組織要堅持圍繞局黨組和本部門本單位的中心任務開展工作，圍繞落實全國中醫藥工作會議任務開展工作，發揮好政治、思想和組織保證作用，協助行政領導貫徹落實黨中央、國務院重大決策部署，把黨建工作融合到行政業務工作中去。
    6、要注意發揮黨員先鋒模范作用，按照中央和工委的部署，認真抓好以實踐“三個代表”重要思想為主要內容的保持共產黨員先進性教育活動，團結和帶領群眾努力完成本部門本單位的各項工作任務。
    7、按照工委制定的《關于加強中央國家機關黨支部書記崗位培訓工作的意見》，建立黨支部書記年度集中培訓制度，通過培訓增強黨支部書記“兩手抓”的意識和能力，提高黨支部工作的水平。同時，各單位每年還要根據本單位實際情況安排好1次局處級領導干部脫產集中學習班。
    8、繼續開展“創先爭優”活動，按照上級工作部署將在“七一”表彰一批先進基層黨組織、優秀共產黨員和優秀黨務工作者，各級黨組織要認真總結經驗，組織好先進典型的推選工作，并不失時機地開展宣傳、學習先進典型的工作。
    9、進一步重視黨員發展工作，注意在生產、工作第一線和高知識群體、青年中發展黨員，把各級各類崗位中的先進分子及時吸收到黨的隊伍中來。
    10、按照中央組織部《關于加強離退休干部黨支部建設的意見》，進一步做好離退休干部黨支部建設工作。
    三、繼續推進作風建設，建設廉潔勤政務實高效、人民滿意的國家機關
    11、要深入貫徹十五屆六中全會精神和十六大報告、中央紀委二次全會提出的新要求，牢牢抓住保持同人民群眾血肉聯系這個核心，按照“八個堅持，八個反對”的要求，繼續注意解決作風方面存在的突出問題，堅決反對和防止腐敗，真正做到執政為民，努力建設廉潔、勤政、務實、高效、人民滿意的國家機關。
    12、要繼續貫徹執行《中國共產黨黨員領導干部廉潔從政若干準則》和各項廉政規定，認真落實黨風廉政建設責任制。堅持抓好領導干部廉潔自律、查處大案要案、糾正部門和行業不正之風的反腐敗三項工作格局，重視抓好黨員領導干部的廉潔自律表率作用；堅持標本兼治、綜合治理的方針，加大治本力度，從源頭上預防和解決腐敗問題；堅持預防為主，教育在前、規范在前、監督在前，有效實現關口前移。
    四、繼續做好維護穩定工作，深入開展同“法輪功”邪教組織的斗爭
    13、不斷深化黨員領導干部的思想認識，落實維護穩定工作責任制和責任追究制，正確處理改革、發展、穩定的關系，切實把改革發展中的維護穩定工作和同“法輪功”邪教組織斗爭的工作，納入“三個代表”重要思想的實踐，納入黨的基層組織建設，納入社會治安綜合治理，納入社會主義精神文明創建活動。
    14、建立維護穩定的長效工作機制，努力探索和把握同“法輪功”邪教組織斗爭的規律和方法，繼續按照“看清自己的人”的要求，認真細致地做好經常性的各種不安定因素的摸底排查工作，并制定切實有效的防范處理預案。
    五、加強思想政治工作，充分調動干部職工的積極性
    15、要進一步做好新形勢下的思想政治工作，針對改革開放中出現的新情況、新問題，及時做好重大改革措施出臺時的思想政治工作。要善于運用說服教育、示范引導和提供服務等方法，切實做好群眾的思想政治工作。
    16、各級黨組織和黨員領導干部要注意傾聽群眾呼聲，關心群眾疾苦，幫助解決群眾的困難，為群眾辦實事、辦好事，充分調動廣大干部群眾的積極性。
    17、要繼續推進局機關和直屬單位的精神文明建設，增強法制意識，開展職業道德、社會公德和家庭美德教育活動，不斷提高職工群眾的思想道德和科學文化素質。
    六、繼續做好統戰工作和群眾工作
    18、要貫徹落實黨的統戰、民族和宗教政策，積極探索民主黨派在中央國家機關參政議政的途徑，加強與黨外民主人士聯系，掌握統戰對象的思想動態，及時反饋他們的意見和建議。
    19、要積極支持工青婦組織圍繞中心、服務大局開展適合自身特點的各種活動，指導工會推進職工民主參與、民主管理和民主監督機關（單位）內部事務的工作，維護好職工群眾的合法權益，關心生活困難的干部職工，繼續開展送溫暖活動；指導團組織開展“讀書、實踐、成才”和“樹典型、學榜樣、趕先進”活動，以黨建帶團建，加強團的基層組織建設和團干部隊伍建設。
    七、努力提高黨務干部隊伍的素質和工作水平
    20、要進一步提高黨務工作者對黨建工作重要性的認識，增強做好黨建工作的責任感、使命感。采取培訓、輪訓、學習、考察等多種形式，提高黨務干部的理論素養、業務素養和工作水平。廣大黨務工作者要爭做刻苦學習、勇于實踐的模范，埋頭苦干、勤奮工作的模范，艱苦奮斗、聯系群眾的模范，執政為民、清正廉潔的模范。