1月15日，中央文明辦（文明辦函[2003]38號文件）批復，經復查確認遼寧省中醫學院附屬醫院、廣東省中醫院、重慶市銅梁縣中醫醫院為全國創建文明行業工作先進單位。
    2月26日，中央國家機關文明辦（國機精辦[2003]5號文件）通報，經復查通過中國中醫研究院西苑醫院、廣安門醫院、眼科醫院繼續保留中央國家機關文明單位榮譽稱號。
    2月26日，中央國家機關五委（綜治、綠化、計生、愛衛、交通）（國機精字[2003]1號文件）通報表彰，國家中醫藥管理局魏蓉霞同志為“中央國家機關計劃生育先進工作者”。
    5月3日，團中央（中青發〔2003〕9號文件）授予中國中醫研究院廣安門醫院護理部干事周嬌媚同志“全國優秀共青團員”稱號，中國中醫研究院西苑醫院團委委員張文江同志“全國優秀共青團干部”稱號。
    5月4日，中央國家機關團工委（國團工發〔2003〕7號文件）授予中國中醫研究院廣安門醫院綜合科護士王恕霞同志“中央國家機關優秀共青團員”稱號，中國中醫研究院西苑醫院腫瘤科團支部書記、護士趙楠同志“中央國家機關優秀共青團干部”稱號。
   5月9日，中央國家機關黨工委辦公室（國工辦發〔2003〕31號文件）授予中國中醫研究院望京醫院SARS醫療隊副護士長王小麗同志、中國中醫研究院望京醫院發熱門診護士長兼腸道門診護士長喬寶紅同志“中央國家機關優秀青年”稱號。
    5月12日，全國婦聯、衛生部聯合授予望京醫院“全國‘三八’紅旗集體”稱號。
    “七一”前夕，一大批在防治非典工作中涌現出來的先進基層黨組織和優秀共產黨員受到各級表彰：中國中醫研究院黨委表彰了23個先進基層黨組織和98名優秀共產黨員；國家中醫藥管理局直屬機關黨委表彰了13個先進基層黨組織和61名優秀共產黨員，其中5個基層黨組織和27名共產黨員受到衛生部直屬機關黨委的表彰，西苑醫院呼吸科黨支部和黃堯洲、汪衛東、喬寶紅等3名同志受到中央國家機關黨工委的表彰，西苑醫院黃堯洲同志還受到中央組織部的全國表彰。另有全國防指、北京市表彰一批先進集體和先進個人。其中機關：
    ——6月27日，衛生部直屬機關黨委（衛機黨發〔2003〕37號文件）決定：授予孫塑倫、洪凈同志“衛生部直屬機關防治非典型肺炎工作優秀共產黨員”稱號。
    ——6月30日，國家中醫藥管理局直屬機關黨委（國中醫藥機黨組〔2003〕22號文件）決定：授予醫政司黨支部、科技教育司黨支部、機關服務中心黨支部“國家中醫藥管理局直屬機關防治非典型肺炎工作先進基層黨組織”稱號，孫塑倫、洪凈、閆樹江、歐陽波、沈志祥、關樹華同志“國家中醫藥管理局直屬機關防治非典型肺炎工作優秀共產黨員”稱號。
    ——7月，國家中醫藥管理局辦公室獲“首都防治非典型肺炎工作先進集體”稱號。
    ——（8月12日，全國防治非典型肺炎指揮部防治組通報表揚，房書亭、孫塑倫、沈志祥、蘇鋼強、吳剛、查德忠同志為“非典防治工作先進個人”。）
    7月16日，團中央（中青發〔2003〕18號文件）授予中國中醫研究院廣安門醫院團委“全國防治非典型肺炎工作先進基層團組織”稱號，中國中醫研究院望京醫院護士袁娜同志“全國防治非典型肺炎工作優秀共青團員”稱號。
    7月16日，中央國家機關工會聯合會（國機工辦字〔2003〕8號文件）通報，國家中醫藥管理局直屬機關工會獲2002年度中央國家機關工會財務工作先進集體三等獎。
    8月5日，衛生部、團中央（衛辦發〔2003〕217號文件）決定繼續認定中國中醫研究院西苑醫院呼吸科護理組、中國中醫研究院廣安門醫院二病區護理組、北京中醫藥大學東直門醫院急診科為全國青年文明號。
    10月8日，中共五寨縣委（五發（2003）38號文件）決定：授予國家中醫藥管理局掛職干部趙文華同志“優秀黨員領導干部”稱號。
    10月22日，中國中醫研究院望京醫院李智獲中央國家機關職工英語風采大賽中年組第三名，國家中醫藥管理局獲優秀組織獎。
    10月23日，中央國家機關黨工委（國工組綜〔2003〕12號文件）通報表揚，國家中醫藥管理局2002年黨內統計報表被評為優秀報表。
   11月15日，中央國家機關團工委（國團工發〔2003〕14號文件）決定：授予中國中醫研究院廣安門醫院急診科醫師趙昕同志、中國中醫研究院西苑醫院護士張麗同志“中央國家機關優秀共青團員”稱號，國家中醫藥管理局直屬機關團委副書記陸建偉同志、中國中醫研究院望京醫院團委副書記李軍同志“中央國家機關優秀共青團干部”稱號。
    12月31日，北京市公安局給予局直屬機關黨委副書記、局綜治辦主任楊銳同志記個人三等功，局辦公室綜合處（保衛處）陳偉、中國中醫研究院行政保衛處處長郭鳳武同志記個人嘉獎。