1月16日，全國維護(hù)婦女兒童權(quán)益協(xié)調(diào)組決定（婦維協(xié)字〔2006〕1號(hào)文件），授予中國中醫(yī)科學(xué)院望京醫(yī)院馬靜同志“全國維護(hù)婦女兒童權(quán)益貢獻(xiàn)獎(jiǎng)”。
    1月27日，國家中醫(yī)藥管理局直屬機(jī)關(guān)黨委決定（國中醫(yī)藥機(jī)黨組〔2006〕4號(hào)），授予國家中醫(yī)藥管理局醫(yī)政司黨支部等24個(gè)黨委（總支、支部）“國家中醫(yī)藥管理局直屬機(jī)關(guān)先進(jìn)基層黨組織”榮譽(yù)稱號(hào)；授予閆冰等120名黨員“國家中醫(yī)藥管理局直屬機(jī)關(guān)優(yōu)秀共產(chǎn)黨員”榮譽(yù)稱號(hào)；授予嚴(yán)建文等24名專兼職黨務(wù)干部“國家中醫(yī)藥管理局直屬機(jī)關(guān)優(yōu)秀黨務(wù)工作者”榮譽(yù)稱號(hào)。
    2月14日，中央國家機(jī)關(guān)7部門（精神文明、綜合治理、綠化、計(jì)劃生育、愛國衛(wèi)生、交通安全、環(huán)境整治）決定（國機(jī)精〔2006〕3號(hào)文件），授予中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院“中央國家機(jī)關(guān)文明單位標(biāo)兵”榮譽(yù)稱號(hào)，授予中國中醫(yī)科學(xué)院西苑醫(yī)院、望京醫(yī)院、眼科醫(yī)院“中央國家機(jī)關(guān)文明單位”榮譽(yù)稱號(hào)，授予中國中醫(yī)科學(xué)院西苑醫(yī)院王書臣同志“中央國家機(jī)關(guān)精神文明建設(shè)先進(jìn)工作者”榮譽(yù)稱號(hào)，授予國家中醫(yī)藥管理局陳偉同志“中央國家機(jī)關(guān)社會(huì)治安綜合治理先進(jìn)工作者”榮譽(yù)稱號(hào)。此外，國家中醫(yī)藥管理局機(jī)關(guān)服務(wù)中心程輝同志獲“首都綠化美化積極分子”榮譽(yù)稱號(hào)，國家中醫(yī)藥管理局獲“北京市人口和計(jì)劃生育先進(jìn)集體”榮譽(yù)稱號(hào)。
    2月27日，中華全國婦聯(lián)決定（婦字〔2006〕7號(hào)文件），授予中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院主任醫(yī)師林蘭同志“全國三八紅旗手”榮譽(yù)稱號(hào)，中國中醫(yī)科學(xué)院西苑醫(yī)院呼吸科護(hù)理組“全國三八紅旗集體”榮譽(yù)稱號(hào)。
    3月1日，中央國家機(jī)關(guān)婦工委決定（國機(jī)婦〔2006〕3號(hào)文件），授予中國中醫(yī)科學(xué)院望京醫(yī)院工會(huì)女職工委員會(huì)“中央國家機(jī)關(guān)先進(jìn)基層?jì)D女組織”榮譽(yù)稱號(hào)。
    3月3日，中央國家機(jī)關(guān)黨工委辦公室通報(bào)表揚(yáng)，2005年國家中醫(yī)藥管理局信息被紫光閣網(wǎng)站采用38條，數(shù)量名列中央國家機(jī)關(guān)90多個(gè)部門的前10名。
    6月21日，中央國家機(jī)關(guān)工會(huì)聯(lián)合會(huì)通報(bào)表彰（國機(jī)工辦發(fā)〔2006〕145號(hào)文件），國家中醫(yī)藥管理局直屬機(jī)關(guān)工會(huì)獲2005年度中央國家機(jī)關(guān)工會(huì)財(cái)務(wù)工作“優(yōu)秀獎(jiǎng)”。
    6月23日，中央國家機(jī)關(guān)黨工委決定（國工發(fā)〔2006〕16號(hào)文件），授予中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院黨委“中央國家機(jī)關(guān)先進(jìn)基層黨組織”榮譽(yù)稱號(hào)，授予中國中醫(yī)科學(xué)院望京醫(yī)院院長(zhǎng)陳珞珈同志“中央國家機(jī)關(guān)優(yōu)秀共產(chǎn)黨員”榮譽(yù)稱號(hào)，授予中國中醫(yī)科學(xué)院眼科醫(yī)院黨委書記張菊敏同志“中央國家機(jī)關(guān)優(yōu)秀黨務(wù)工作者”榮譽(yù)稱號(hào)。
    7月28日，在中央國家機(jī)關(guān)工會(huì)聯(lián)合會(huì)東四聯(lián)絡(luò)片第七屆保齡球比賽中，由張印生、秦樹坤、冉升起、李曉明、唐日晶、吳杰、王建中、劉陽等同志組成的國家中醫(yī)藥管理局第一代表隊(duì)奪得第四名。
    9月6日，中央國家機(jī)關(guān)第二屆職工書畫攝影展覽組委會(huì)通報(bào)，中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院王濤同志的書法作品獲中央國家機(jī)關(guān)第二屆職工書畫攝影展覽書法部分“三等獎(jiǎng)”，中國中醫(yī)科學(xué)院高合年、趙樹啟、李阿梅、西苑醫(yī)院唐旭東、白一清、甄明玉、鄭靖鐵、信息所張桂琴、基礎(chǔ)所李素霞、中國中醫(yī)藥報(bào)社胡春福、高新軍等同志的作品分別獲書法部分、美術(shù)部分和攝影部分的“優(yōu)秀獎(jiǎng)”，國家中醫(yī)藥管理局獲中央國家機(jī)關(guān)第二屆職工書畫攝影展覽“基層活動(dòng)獎(jiǎng)”。
    9月8日，在衛(wèi)生部、國家中醫(yī)藥管理局第五次職工運(yùn)動(dòng)會(huì)上，中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院、西苑醫(yī)院、望京醫(yī)院分別奪得團(tuán)體總分第一、第二名、第八名的優(yōu)異成績(jī)。一大批運(yùn)動(dòng)員在許多項(xiàng)目中取得了好成績(jī)，共獲得25塊金牌、26塊銀牌和22塊銅牌。
    10月，中央國家機(jī)關(guān)團(tuán)工委向中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院音樂舞蹈詩《中醫(yī)之光》、中國中醫(yī)科學(xué)院望京醫(yī)院踢踏舞《天使踢踏》頒發(fā)“青春·祖國”第二屆中央國家機(jī)關(guān)青年文化季文藝匯演“優(yōu)秀獎(jiǎng)”。
    11月6日，中央國家機(jī)關(guān)黨工委組織部、《紫光閣》雜志社通報(bào)，在“鞏固先進(jìn)性教育活動(dòng)成果，增強(qiáng)基層黨組織活力，創(chuàng)建學(xué)習(xí)型黨支部”主題征文活動(dòng)中，中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院藥劑科黨支部書記張靜茹同志的《樹立終身學(xué)習(xí)理念，努力構(gòu)建學(xué)習(xí)型黨支部》獲“優(yōu)秀獎(jiǎng)”，局直屬機(jī)關(guān)黨委辦公室獲“組織獎(jiǎng)”。
    11月8日，中央國家機(jī)關(guān)黨工委組織部通報(bào)，國家中醫(yī)藥管理局直屬機(jī)關(guān)黨委黨內(nèi)統(tǒng)計(jì)報(bào)表獲中央國家機(jī)關(guān)2005年度全優(yōu)報(bào)表。
    12月25日，北京市公安局給予國家中醫(yī)藥管理局辦公室綜合處張印生、局機(jī)關(guān)服務(wù)中心關(guān)樹華、趙立光同志嘉獎(jiǎng)，給予中國中醫(yī)科學(xué)院行政保衛(wèi)處記集體三等功。
    12月25日，中央國家機(jī)關(guān)團(tuán)工委決定（國團(tuán)工發(fā)〔2006〕11號(hào)文件），命名中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院藥劑科調(diào)劑室和繼續(xù)認(rèn)定中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院針灸科、西苑醫(yī)院藥劑科中草藥調(diào)劑組、望京醫(yī)院創(chuàng)傷一科護(hù)理組為“2005年度中央國家機(jī)關(guān)青年文明號(hào)”。