2011年9月19日，南京中醫藥大學和皇家墨爾本理工大學合作建立的中醫孔子學院首屆理事會第二次全體會議在南京召開。國家中醫藥管理局副局長于文明出席了會議開幕式并致辭。
    于文明在講話中對兩所院校在開展中醫藥學歷教育和中醫藥文化推廣中的合作及所取得的成果給予了充分肯定，表示開辦中醫孔子學院對于弘揚中華優秀文化，增強中華民族凝聚力，提高中華文化國際影響力，具有十分重要的意義。希望中醫孔子學院能緊緊抓住中醫學和對外漢語教學當前所面臨的難得歷史機遇，以漢語言為載體，進一步整合資源，體現質量為本，堅持科學發展，因地制宜、正確定位，走特色化的發展道路，促進中醫藥和漢語國際推廣的良性互動及可持續發展。于文明特別強調中澳兩國應該利用好世界衛生組織第62屆大會上通過的《傳統醫學決議》，積極推動傳統醫學進入本國的主流醫學體系，中國也將與澳大利亞及其它國家共同努力，促進傳統醫學的發展。
    作為中澳兩國中醫藥領域具有重要影響的高等學府，南京中醫藥大學和皇家墨爾本理工大學在過去十多年富有成效的合作基礎上，又成功開辦了中醫孔子學院。此次會議得到了雙方的高度重視，南京中醫藥大學和皇家墨爾本理工大學的校領導均出席了會議。